วัดนครชี่นชุ่ม เริ่มสร้างเมื่อวันที่ ๕ มีนาคม พ.ศ. ๒๔๗๕ ซึ่งมีขุนนครรัฐเขตต์ เป็นนายอำเภอสามพราน และมีนายโปร่ง พรหมประภัสสร เป็นกำนันตำบลกระทุ่มล้ม ในขณะนั้น ได้ปรึกษาหารือกันที่จะสร้างวัดขึ้นในบริเวณตำบลกระทุ่มล้ม ทะเบียนบ้านเลขที่ ๑๐๔ หมู่ที่ ๗ ตำบลกระทุ่มล้ม อำเภอสามพราน จังหวัดนครปฐม โดยปรึกษากับนายเทียนเต๊ก กรรณสูตร ผู้เป็นเจ้าของที่ดิน ซึ่งท่านได้อุทิศที่ดินแปลงนี้ให้สร้างเป็นวัด จำนวน ๒๐ ไร่ ต่อมาได้แยกโฉนดที่ดินออกเป็นสองแปลง สร้างเป็นโรงเรียนบ้านกระทุ่มล้มหนึ่งแปลงจำนวน ๕ ไร่ ๑ งาน ๘๐ ตารางวา อีกหนึ่งแปลงสร้างเป็นวัดนครชื่นชุ่มจำนวน ๑๔ ไร่ ๓ งาน ๒๐ ตารางวา ต่อมานายโปร่ง พรหมประภัสสร ได้ติดต่อเนื้อที่เพื่อสร้างวัดเพิ่มเติมจากผู้ที่อยู่บริเวณใกล้เคียงกับวัด โดยมีนางมาก สงกา อุทิศให้จำนวน ๒ ไร่ ๓ งาน นางแคลน ปราจีนบูรวรรณ จำนวน ๑ ไร่ ๒ งาน นางผาด ศรีสวัสดิ์ จำนวน ๓ งาน นายบุญชู มีประมูล จำนวน ๒ งาน รวมเป็นเนื้อที่ทั้งหมด ๑๙ ไร่ ๑ งาน ๒๐ ตารางวา และได้ขุดคูล้อมรอบวัด เริ่มแรกเดิมทีเรียกวัดแห่งนี้ว่า “วัดตาโปร่ง” เพราะกำนันโปร่งฯ เป็นผู้ที่มีบทบาทในการดำเนินการสร้างวัดอยู่ในขณะนั้น ซึ่งต่อมาได้เปลี่ยนชื่อวัดใหม่ว่า “ชื่นชุ่ม” อย่างเป็นทางการในทะเบียนวัด เพราะที่ดินดั้งเดิมเป็นของนายชื่น-นางชุ่ม ในปี พ.ศ.๒๕๐๐ ได้ขออนุญาตเปลี่ยนชื่อวัดจาก “ชื่นชุ่ม” เป็นวัด “นครชื่นชุ่ม” เพื่อให้เป็นเกียรติแก่ ขุนนครรัฐเขตต์ ซึ่งเป็นผู้ริเริ่มในการสร้างวัด ขุนนครรัฐเขตต์ ได้เชิญ ฯพณฯ จอมพล ป.พิบูลสงคราม นายกรัฐมนตรีในขณะนั้น เป็นประธานในพิธียกช่อฟ้าพระอุโบสถ